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    首頁   >    新聞資訊   >   費(fèi)氏弧菌發(fā)光桿菌中“隱秘”基因簇大揭底

    費(fèi)氏弧菌發(fā)光桿菌中“隱秘”基因簇大揭底

    點(diǎn)擊次數(shù):822次  更新時(shí)間:2017-10-18

    費(fèi)氏弧菌發(fā)光桿菌作為自然界第二大類生物,是天然藥物創(chuàng)制的重要來源。然而,大量真菌基因組測(cè)序表明,真菌中超過 90% 的次級(jí)代謝產(chǎn)物合成基因簇處于沉默狀態(tài),極大地限制了新代謝產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)及其合成機(jī)制研究。中國科學(xué)院微生物研究所真菌學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究員尹文兵課題組針對(duì)真菌中大量“隱秘”基因簇的問題,長(zhǎng)期從事從基因到次級(jí)代謝產(chǎn)物的研究,主要方向包括真菌次級(jí)代謝產(chǎn)物激活、生物合成及其調(diào)控機(jī)制研究,近一年來取得了三個(gè)具有系統(tǒng)性和原創(chuàng)性的成果。

    “這三個(gè)成果是天然產(chǎn)物發(fā)現(xiàn)及后續(xù)改造利用的上游和下游的關(guān)系。”尹文兵解釋。

    *個(gè)成果是使用表觀遺傳策略挖掘真菌天然產(chǎn)物多樣性。他們通過對(duì)植物內(nèi)生真菌無花果擬盤多毛孢中的表觀遺傳調(diào)控因子進(jìn)行定向遺傳敲除,發(fā)現(xiàn)該菌的次級(jí)代謝產(chǎn)物指紋圖譜發(fā)生了巨大變化,從中分離鑒定得到了 15 個(gè)新的聚酮類天然產(chǎn)物,并通過同位素示蹤法闡釋了產(chǎn)物 Ficiolide A 的合成途徑。

    “我們通過對(duì)遺傳轉(zhuǎn)化技術(shù)進(jìn)行改良,大大縮短了真菌轉(zhuǎn)化的周期,該研究為新天然產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)提供了的方法。”

    在此基礎(chǔ)上,科學(xué)家們開展了生物合成機(jī)制研究,闡明重要生防菌淡紫擬青霉中脂肽類抗生素 leucinostatins 的生物合成途徑。

    在與中國農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院蔬菜花卉研究所研究員謝丙炎課題組的合作下,科學(xué)家們通過對(duì)淡紫擬青霉進(jìn)行基因組測(cè)序并結(jié)合比較基因組學(xué)分析,預(yù)測(cè)了脂肽類抗生素 leucinostatins 的合成基因簇。再通過對(duì)候選基因的遺傳敲除,鑒定了 leucinostatins 的合成基因簇,并且解析了其合成途徑。這一工作對(duì)防治植物線蟲等多種病蟲害藥物的開發(fā)奠定了理論基礎(chǔ)。

    此后,尹文兵又和北京大學(xué)藥學(xué)院葉敏團(tuán)隊(duì)合作,費(fèi)氏弧菌發(fā)光桿菌將真菌糖基轉(zhuǎn)移酶應(yīng)用于天然產(chǎn)物成藥性改善。
    T細(xì)胞調(diào)控相關(guān)蛋白抗體    英文縮寫:    CRTAM
    突觸后蛋白CRIPT抗體    英文縮寫:    CRIPT
    鈣粘附蛋白8抗體    英文縮寫:    Cadherin 8
    6號(hào)染色體開放閱讀框174抗體    英文縮寫:    C6orf174
    6號(hào)染色體開放閱讀框150抗體    英文縮寫:    C6orf150
    X染色體開放閱讀框56抗體    英文縮寫:    CXorf56
    9號(hào)染色體開放閱讀框152抗體    英文縮寫:    C9orf152
    6號(hào)染色體開放閱讀框58抗體    英文縮寫:    C6orf58
    接觸蛋白相關(guān)蛋白4抗體    英文縮寫:    CNTNAP4
    CD24抗體    英文縮寫:    CD24
    接觸蛋白相關(guān)蛋白3抗體    英文縮寫:    CNTNAP3 
    CD24抗體    英文縮寫:    CD24
    限局性核因子3抗體    英文縮寫:    NLF3
    胰羧肽酶A6抗體    英文縮寫:    CPA6
    費(fèi)氏弧菌發(fā)光桿菌

     

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